Wystawę "Nasi chłopcy", poświęconą mieszkańcom Pomorza wcielonym do armii III Rzeszy, skrytykowali były, jak i obecny szef MON. Zdaniem Mariusza Błaszczaka gdańska ekspozycja to "jawna realizacja niemieckiej narracji". Władysław Kosiniak-Kamysz napisał, że "nasi chłopcy, żołnierze i cywile, Polacy, bronili Ojczyzny przed nazistowskimi Niemcami do ostatniej kropli krwi". "To oni są bohaterami i to im należą się miejsca na wystawach" - dodał. Krytyki dla Muzeum Gdańska nie szczędził także prezydent Andrzej Duda.